上海交通大學生命科學技術學院微生物學特聘教授，微生物分子生態(tài)學與生態(tài)基因組學實驗室主任，上海系統(tǒng)生物醫(yī)學研究中心營養(yǎng)系統(tǒng)生物學實驗室主任，上海交大－完美中國微生態(tài)健康聯(lián)合研究中心主任。1989年南京農業(yè)大學博士畢業(yè)。1993-1995康奈爾大學訪問學者。2004－2012擔任上海交通大學生命科學技術學院副院長。2005-2009，上海系統(tǒng)生物醫(yī)學研究中心常務副主任。2009年度上海市優(yōu)秀學科帶頭人。2006－2012擔任國際微生物生態(tài)學會（ISME）常務理事。 Journal of Molecular Medicine，F(xiàn)EMS Microbiology Ecology，Microbial Biotechnology等國際刊物編委；ISME Journal（國際微生物生態(tài)學會會刊，影響因子9.3）的資深編輯，Scientific Report編委。2014年被選為美國微生物科學院院士。 他領導的團隊是國際知名的微生物分子生態(tài)學研究小組，在復雜微生物群落結構分析技術和統(tǒng)計計算方法、結構與功能相關性、功能細菌分離及機制研究等方面做了很多創(chuàng)新性工作，特別在腸道菌群與肥胖等代謝性疾病的關系研究中，提出“代謝性疾病的腸源性學說”，發(fā)現(xiàn)并驗證了首例能夠引起肥胖癥的人體腸道細菌。在美國科學院院報（PNAS）, 國際微生物生態(tài)學會會刊（ISME Journal）、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology, EBioMedicine等刊物發(fā)表論文四十余篇。應邀在國際微生物生態(tài)學大會、國際人類微生物組大會、國際糖尿病技術大會、美國微生物學會年會等一系列國際會議做大會報告、特邀報告。目前的研究重點是，營養(yǎng)如何通過改變菌群從而影響代謝性疾病的發(fā)生和發(fā)展，以及如何挖掘、利用中國傳統(tǒng)養(yǎng)生食材和中醫(yī)藥中的有效成分，通過調理菌群結構進行肥胖、糖尿病等代謝性疾病的預防和治療。2012年6月，美國《科學》周刊曾對他的研究工作做過專題報道(Science 336: 1248)。