R語(yǔ)言生信數(shù)據(jù)分析及可視化作圖（網(wǎng)絡(luò)）研討會(huì)

騰訊會(huì)議網(wǎng)絡(luò)會(huì)議室 2023年1月7-8日

會(huì)議簡(jiǎn)介：

眾所周知，R軟件是用來(lái)做數(shù)據(jù)分析和作圖的軟件。一篇高質(zhì)量的文章，需要好的原始數(shù)據(jù)、邏輯的分析思路、漂亮的結(jié)果、創(chuàng)新的結(jié)論。其中，批量的分析操作會(huì)提高效率，美觀的圖片會(huì)讓人眼前一亮，刮目相看的。相同的數(shù)據(jù)，做出來(lái)的圖片可能大相徑庭。

下圖就是由同一套數(shù)據(jù)所做的差異基因的表達(dá)聚類(lèi)熱圖，孰優(yōu)孰劣一目了然。

R語(yǔ)言特點(diǎn)及優(yōu)勢(shì)

可以用來(lái)做生信分析及作圖的數(shù)據(jù)庫(kù)database、在線(xiàn)工具web-service、軟件software有很多，其中R軟件是一種適應(yīng)性最廣、上手最快的工具?？赡苡械娜藭?huì)有疑問(wèn)，R語(yǔ)言是一種編程語(yǔ)言，我沒(méi)有任何計(jì)算機(jī)的基礎(chǔ)也適合使用R嗎？

答案是可以的。原因是R軟件做分析及作圖，都有比較現(xiàn)成的R包及代碼。比如轉(zhuǎn)錄組分析相關(guān)的R包及代碼，可以用來(lái)做差異分析、火山圖、熱圖、PCA圖、WGCNA等。比如單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析相關(guān)的R包及代碼，可以用來(lái)做細(xì)胞分型及聚類(lèi)。還有RNA甲基化分析相關(guān)的、蛋白組代謝組相關(guān)的、臨床統(tǒng)計(jì)分析相關(guān)的R包及代碼。

零基礎(chǔ)的是怎么快速掌握呢？以一個(gè)做熱圖的代碼為例子，雖然每個(gè)人的數(shù)據(jù)是不同的，但是只要拿到了做熱圖的代碼，我們就可以只是簡(jiǎn)單的修改其中幾個(gè)參數(shù)，就可以輕松作出熱圖！我們只需要記住那幾個(gè)關(guān)鍵參數(shù)的含義及修改即可，而且，代碼中還有詳細(xì)的中文注釋?zhuān)?/span>

當(dāng)然，如果是我們自學(xué)就要花費(fèi)更多的時(shí)間了。所以，我們開(kāi)設(shè)了這次R語(yǔ)言實(shí)操班?？梢酝ㄟ^(guò)老師系統(tǒng)的整理各個(gè)方向的生信代碼及實(shí)操，在短短的兩天一晚時(shí)間系統(tǒng)的掌握R分析的各種實(shí)操

有很多學(xué)員也參加過(guò)醫(yī)藥加的其他培訓(xùn)班，比如單細(xì)胞、比如RNA甲基化、TCGA、多組學(xué)、非編碼RNA等，它們也有一些R的操作及代碼。我們這次也會(huì)系統(tǒng)性的對(duì)這些班中的R代碼進(jìn)行教學(xué)演練，希望大家?guī)е鴨?wèn)題解決問(wèn)題。

專(zhuān)家簡(jiǎn)介：宋博士

成果：參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專(zhuān)利的撰寫(xiě)和申請(qǐng)；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫(kù)的分析和構(gòu)建；完成個(gè)體基因檢測(cè)流程和無(wú)創(chuàng)唐篩流程的開(kāi)發(fā)。

研究方向：有近十年的生信分析經(jīng)驗(yàn)，擅長(zhǎng)方向有轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機(jī)理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項(xiàng)目分析思路設(shè)計(jì)以及個(gè)性化分析等，精通perl、R等編程語(yǔ)言。

會(huì)議預(yù)期：通過(guò)2天1晚的學(xué)習(xí)的手把手教學(xué)讓學(xué)員掌握R軟件下載安裝、Rstudio用法、R語(yǔ)言常用作圖、R語(yǔ)言數(shù)據(jù)處理方法與編程技術(shù)、掌握R語(yǔ)言自主學(xué)習(xí)實(shí)踐的方法與技巧，現(xiàn)場(chǎng)解答學(xué)員在實(shí)際工作中遇到的有關(guān)技術(shù)問(wèn)題，讓學(xué)員更好地掌握相關(guān)技術(shù)的應(yīng)用。另外，課后學(xué)員有感興趣的圖片，老師也可以提供相應(yīng)的R代碼。

總體思路是根據(jù)生信相關(guān)的SCI熱點(diǎn)文章為主題，完成里面相關(guān)的分析及作圖。該培訓(xùn)適用于對(duì)生信分析或者醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析感興趣，編程零基礎(chǔ)及以上的學(xué)員參加。

會(huì)議詳細(xì)日程

PS：必須攜帶電腦，最好是win10系統(tǒng)，蘋(píng)果系統(tǒng)需自己安裝好R和Rtudio軟件。會(huì)后主辦方會(huì)統(tǒng)一提供全程錄像作為復(fù)習(xí)資料。

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通過(guò)該培訓(xùn)，可以學(xué)會(huì)R語(yǔ)言基礎(chǔ)（輸入文件格式、輸出文件格式、操作代碼的參數(shù)調(diào)整）、統(tǒng)計(jì)學(xué)上各種算法的實(shí)現(xiàn)、SCI常用圖片生成等，例如：

具體示例可添加微信客服HDJVIPKEFU查看。?