宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學R軟件數(shù)據(jù)可視化研討會

2023年3月25-26日 騰訊會議網(wǎng)絡(luò)會議室

【背景介紹】

微生物是自然界中分布最廣、種類最多、數(shù)量最大的生物類群。以腸道微生物為例，人體內(nèi)微生物的總數(shù)量約是人體細胞總數(shù)的10倍 —— 越來越多的研究發(fā)現(xiàn)，腸道微生物與人體健康有著密切的關(guān)系，而微生物產(chǎn)生的代謝物是調(diào)控過程中最主要的中間遞質(zhì)之一。

宏基因組研究包括16s測序和宏基因組測序，可以獲得微生物群落豐度以及組成。通過分析可以獲得關(guān)鍵菌群以及功能，為疾病治療提供研究基礎(chǔ)。

代謝組學和脂質(zhì)組學是基于LC-MS液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對生物樣本中的小分子代謝物/脂質(zhì)分子進行定性和相對定量分析。嚴格來講，脂質(zhì)組也是代謝組的一種。

宏基因組-代謝組/脂質(zhì)組的聯(lián)合分析能夠從多個維度闡釋一個科學問題，可以用來解釋差異菌群與差異代謝物的關(guān)聯(lián)性，從而幫助建立微生物-代謝物-表型之間的邏輯關(guān)系。

基于以上原因，醫(yī)藥加推出“宏基因組+代謝組/脂質(zhì)組聯(lián)合分析”R軟件實操課程，帶您充分挖掘數(shù)據(jù)，掌握生信高級分析能力。

【主要內(nèi)容】詳細內(nèi)容見下文日程表

1. 宏基因組生信文章解讀與報告解讀；
2. R和Rstudio軟件安裝，宏基因組與代謝組/脂質(zhì)組學聯(lián)合分析實操；
3. 生信SCI文章實用數(shù)據(jù)處理與圖片導出。

【會議預期】

本課程通過兩天的時間學習，讓我們對宏基因組腸道菌群分析，代謝組脂質(zhì)組小分子分析，以及組學整合數(shù)據(jù)處理分析，有一個全面的了解。并使用R語言進行分析及可視化作圖，得到SCI水平的圖片。

【講師簡介】

宋偉博士

成果：參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建；完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。

研究方向：有近十年的生信分析經(jīng)驗，擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等，精通perl、R等編程語言。

培訓經(jīng)歷：在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場現(xiàn)場培訓班。

主辦方：上海遐錦生物科技有限公司

會議時間：2023年3月25-26日

會議地點：線上：騰訊會議網(wǎng)絡(luò)會議室

收費標準：會務(wù)費：線上：2800元/人；

優(yōu)惠政策：

1.提前確認報名及轉(zhuǎn)賬的，可以提前拿到學習材料

2.三人組團報名，每人優(yōu)惠100元

3.四人組團報名，每人優(yōu)惠200元，

4.六人組團報名繳費，可免1人會務(wù)費！

可以開正規(guī)會務(wù)發(fā)票，紙質(zhì)邀請函（蓋紅章）。

注意事項：必須攜帶win10以上系統(tǒng)的電腦，現(xiàn)場不得錄音錄像。上課軟件為R和Rstudio。會后主辦方會統(tǒng)一提供錄屏作為復習資料。

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示例圖展示：

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示例圖 箱線圖

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示例圖 PCoA圖

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示例圖 物種組成柱狀圖

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示例圖 熱圖

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示例圖 venn圖

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示例圖 PCA分析

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示例圖 差異結(jié)果

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示例圖 代謝物的pathway map圖

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示例圖 Lefse樹狀圖

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