丁香園&基因課2019年R語言與數(shù)據(jù)表達培訓班(12月上海)
時間:2019-12-20 08:00 至 2019-12-22 18:00
地點:上海

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首頁 > 商務(wù)會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > 丁香園&基因課2019年R語言與數(shù)據(jù)表達培訓班(12月上海) 更新時間:2019-09-25T17:15:20
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丁香園&基因課2019年R語言與數(shù)據(jù)表達培訓班(12月上海) 已截止報名會議時間: 2019-12-20 08:00至 2019-12-22 18:00結(jié)束 主辦單位: 丁香園 |
會議介紹
會議內(nèi)容 主辦方介紹
丁香園&基因課2019年R語言與數(shù)據(jù)表達培訓班(12月上海)宣傳圖
三天教學內(nèi)容:
1. 獲得比較扎實的 R 語言基礎(chǔ);
2. 能夠用 R 語言進行數(shù)據(jù)分析;
3. 能夠使用 ggplot2 繪制常見圖形;
4. 掌握 PCA、共表達、聚類、Heatmap、富集、Cytoscape 等分析;
5. 掌握 GEO、TCGA 數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)的下載、挖掘。
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適合人群
推薦醫(yī)學研究者和學生;
零基礎(chǔ)學員參
作為大型醫(yī)院來說,科研成果是非常重要的參與綜合考量的指標。而作為一名臨床醫(yī)師,不管愿意不愿意,都要一邊忙繁忙的臨床工作,一邊應(yīng)付復雜的醫(yī)患關(guān)系,還要擠出時間兼顧醫(yī)學科研。一天二十四小時,醫(yī)生恨不得過成二十五小時:?
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臨床醫(yī)生科研本就薄弱,做實驗攢數(shù)據(jù)勞心勞力。
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夢想升主治醫(yī)師,評職稱拿基金全要拼 SCI 文章?
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好不容易得到測序數(shù)據(jù),聚類分析,富集分析還是不會做?
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想用 R 語言分析基因芯片和 TCGA 數(shù)據(jù),但是不知道如何入手?
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想做高水平的科學數(shù)據(jù)分析圖,但是連個熱圖都畫不出來?
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不論是為了評職稱,為了畢業(yè),還是為了提高文章質(zhì)量而希望學習 R 語言的朋友們,這次有福了!
丁香園攜手張旭東老師專為醫(yī)學生及生信零基礎(chǔ)的初學者量身打造線下培訓課程《R 語言與數(shù)據(jù)表達培訓班》,從安裝軟件到差異表達分析、火山圖富集分析、生存分析、Cytoscape 網(wǎng)絡(luò)圖繪圖、GEO 與 TCGA 數(shù)據(jù)挖掘、ggplot2 繪圖等,手把手教學,不懂就問,再也不因為找不到 bug 抓耳撓腮了。
與其三天打魚兩天曬網(wǎng)地用零碎時間學習,不僅吃力且效率低下,還不如好好利用三天時間向?qū)I(yè)的老師系統(tǒng)地學習,一口氣吃透 R 語言!
是不是很心動?還有更心動的:
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心動一
干貨滿滿 全方位配套內(nèi)容
首先,本次課程不僅僅是一次線下課程,你還將得到非常貼心的配套內(nèi)容:
課程所有理論均有現(xiàn)場實操練習
贈送相關(guān)生物信息教材
贈送 14?門以上視頻課程
贈送自動化腳本、流程和測試數(shù)據(jù)
贈送高性能服務(wù)器,免費用一整年
贈送必備生物信息軟件、數(shù)據(jù)庫
加入 VIP 交流答疑群
也就是說普通的三天線下培訓怎么夠,真正的內(nèi)容不止三天!
課前視頻教學(預習)+現(xiàn)場實操練習(動手)+課后問題交流(復習)
雖然三天很難從小白一下子變成 R 語言高手,可是在這里,你能邁開第一步,不會擔心裝不上各種軟件,不會看不懂公司反饋的分析圖,給自己信心,才是成為高手的第一步。
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心動二
專為醫(yī)學生和零基礎(chǔ)者設(shè)計
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經(jīng)過上次培訓的經(jīng)驗總結(jié),生物學霸和張老師決定為醫(yī)學生或相關(guān)專業(yè)設(shè)計 R 語言課程,學完本次課程,你將收獲:
1. 比較扎實的 R 語言基礎(chǔ);
2. 能夠用 R 語言進行數(shù)據(jù)分析;
3. 能夠使用 ggplot2 繪制常見圖形;
4. 掌握 PCA、共表達、聚類、Heatmap、富集、Cytoscape 等分析;
5. 掌握 GEO、TCGA 數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)的下載、挖掘;
6. 了解其他領(lǐng)域的方法在醫(yī)學領(lǐng)域中的推廣;
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丁香園成立于2000年7月23日,一直致力于醫(yī)藥及生命科學領(lǐng)域的互聯(lián)網(wǎng)實踐,是目前行業(yè)規(guī)模最大, 并極具影響力的社會化媒體平臺。丁香園用戶超過400萬,我們?yōu)橛脩籼峁┒喾N形式的交流平臺和工具, 我們的產(chǎn)品和服務(wù)幫助專業(yè)用戶提高生產(chǎn)力;我們服務(wù)的客戶達數(shù)千家,并分布在全球各地,我們提供針對專業(yè)用戶的精準數(shù)字化營銷等服務(wù)。 丁香園正嘗試將服務(wù)的范圍擴展到大健康領(lǐng)域,利用我們的優(yōu)質(zhì)醫(yī)療資源,結(jié)合互聯(lián)網(wǎng)和移動互聯(lián)網(wǎng)的手段為大眾健康服務(wù)。
會議日程
(最終日程以會議現(xiàn)場為準)
會議安排
第一天 9:00~12:00
R 語言基礎(chǔ)
1. R語言介紹
2. 快速入門:通過一個例子,30分鐘理解編程語言的體系框架
3. 環(huán)境部署:R、Rstudio、包的安裝
4. 數(shù)據(jù)類型:數(shù)值型、字符型、邏輯型
5. 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu):向量、數(shù)據(jù)框、列表、因子等
6. 流程控制:循環(huán)、條件
7. 輸入輸出
第一天 14:00~18:00
表達數(shù)據(jù)挖掘原理
1. 表達芯片與轉(zhuǎn)錄組測序原理
2. 表達數(shù)據(jù)挖掘思路串講,鎖定關(guān)鍵基因與鎖定關(guān)鍵樣本有哪些方法?
3. 差異表達與假設(shè)檢驗,更多生物學重復還是更多數(shù)據(jù)量?
4. 富集分析,多種富集分析方法,GSEA等?
5. 相關(guān)性分析,生物學重復好不好?如何提取表達模式相似的基因?
6. 主成分分析,降低數(shù)據(jù)維度,簡化分析
7. 聚類分析?搞清楚樣本關(guān)系,將功能相似的基因聚成模塊
8. WGCNA:探索模塊與性狀的關(guān)系,腫瘤分期如何作為性狀?
9.有哪些其他領(lǐng)域的研究方法可以推廣到醫(yī)學研究中?
第二天 9:00~12:00
表達數(shù)據(jù)挖掘?qū)嵅?/strong>
1. 差異表達分析及火山圖繪制
2. 富集分析及圖表繪制
3. 相關(guān)性分析及繪圖
4. 聚類分析與繪圖
5. Heatmap 繪圖,各種復雜的熱圖繪制
第二天 14:00~18:00
表達數(shù)據(jù)挖掘?qū)嵅?/strong>
1. 主成分分析與繪圖
2. WGCNA,加權(quán)共表達分析與繪圖
3. Cytoscape 網(wǎng)絡(luò)圖繪圖
4. 富集分析,GSEA
5. 生存分析會繪圖
第三天 9:00~12:00
GEO 與 TCGA 數(shù)據(jù)挖掘
1. SRA 數(shù)據(jù)庫介紹
2. GEO 數(shù)據(jù)庫介紹及數(shù)據(jù)下載和整理
3. TCGA 腫瘤數(shù)據(jù)庫介紹及數(shù)據(jù)下載和整理
4. GEO、TCGA 分析流程和代碼參數(shù)講解(贈送全套流程代碼)
第三天 14:00~18:00
Tidyverse:數(shù)據(jù)處理與ggplot2繪圖
1. Ti bble 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)介紹,與數(shù)據(jù)框的轉(zhuǎn)換
2. 使用 tidyr 進行數(shù)據(jù)變形
3. 使用 dplyr 進行數(shù)據(jù)處理和統(tǒng)計
4. ggplot2 基本概念:圖層、映射、標度、幾何對象、統(tǒng)計變換、主題、坐標
5. 繪圖實戰(zhàn):散點圖、條形圖、直方圖、箱線圖、小提琴圖、密度圖等
6. 圖形美化:主題設(shè)置
7. 實用技巧:分面、一頁多圖等
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會議嘉賓
(最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準)
華大基因一線工程師,學員好評如潮
張旭東老師:CNS 一作、一線工程師、基因課創(chuàng)始人
曾任華大基因項目組組長、產(chǎn)品研發(fā)組組長,自 2017 年起,專注生物信息學培訓,累計學員 3000?余人。
發(fā)表文章:麻瘋樹基因組計劃(the plant journal)、鷹嘴豆基因組計劃(Nature Biotechnology)、?芝麻基因組計劃(Genome Biology)、獼猴桃群體研究(New Phytologist)。
培訓經(jīng)歷:已完成 14 門視頻課程的開發(fā),在武漢、成都、西安、杭州、廣州、北京等地舉辦快速入門班11期、周末成長班 2 期。培訓對象包括醫(yī)生、學生、科研工作者以及生信愛好者等。
王瑩老師:曾任華大基因、貝納基因高級生物信息工程師
九年生物信息從業(yè)經(jīng)驗,擅長基因組拼接、比較基因組和進化分析。
發(fā)表文章:甲藻基因組(Science)、穿心蓮基因組(The Plant Journal)、野生大豆基因組(Nature Communications)、菊花基因組(Molecular Plant)、鷹嘴豆基因組計劃(Nature Biotechnology)、 芝麻基因組計劃(Genome Biology)、獼猴桃群體研究(New Phytologist)。
用戶好評???????
張老師的培訓課程已經(jīng)順利開展了 13 期,給學員們提供一個系統(tǒng)的入門途徑,加上張老師隨和耐心的講解,收獲了學員一致好評。
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參會指南
會議門票
票種名稱 | 價格 | 原價 | 票價說明 |
會務(wù)費 | ¥3600 | ¥ | 只包含學習費用,食宿交通費自理 |
3人及以上團購 | ¥3300 | ¥3600 | 只包含學習費用,食宿交通費自理 |
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溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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