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      首頁 > 培訓(xùn)課程 > 生物/醫(yī)學(xué)培訓(xùn) > 多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會 更新時間:2020-06-22T13:04:43

      大會站點分布:
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      多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會
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      官方合作

      多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會 已截止報名

      課程時間: 2020-07-17 08:00至 2020-07-19 18:00結(jié)束

      課程地點: 線上活動 

      主辦單位: 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 上海遐永醫(yī)藥科技 上海遐錦生物科技有限公司

      行業(yè)熱銷熱門關(guān)注看了又看 換一換

            會議介紹

            會議內(nèi)容 主辦方介紹


            多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會

            多組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會宣傳圖

            ?組學(xué)數(shù)據(jù)整合挖掘與分析(網(wǎng)絡(luò))研討會

            醫(yī)藥加ZOOM網(wǎng)絡(luò)會議室 2020年7月17-19日(兩天兩晚)

            【背景介紹】

            2019年度國家自然基金醫(yī)學(xué)科學(xué)部共批資助10138項目,批助金額總計441310萬元。這些項目中大部分都與編碼基因有直接或間接的關(guān)聯(lián)。其中,與通路(pathway)關(guān)聯(lián)的有1349項,金額4.89億;與miRNA相關(guān)的有630項,金額2.3億;與lncRNA相關(guān)的有395項,金額1.45億,與甲基化相關(guān)的有213項,金額8748萬,與突變相關(guān)的有190項,金額7410萬;?

            如何獲得有創(chuàng)新意義的疾病靶標基因(mRNA,Protein,lncRNA,circRNA,miRNA,Mutation等)是項目申請及文章寫作時最常見的問題。

            目前,多組學(xué)整合分析是一個非常熱門且創(chuàng)新的方向。通過多組學(xué)整合分析我們可以更加快速、準確的找到與研究方向關(guān)聯(lián)的biomarks。它的核心原理是期望通過高通量數(shù)據(jù),找到所有基因在不同組學(xué)水平中的變化并進行分析,獲得關(guān)鍵基因在各個組學(xué)都有顯著作用。

            多組學(xué)整合分析的原始數(shù)據(jù)來源有兩種:(1)自己采集樣本做高通量測序/芯片/質(zhì)譜等;(2)使用公共數(shù)據(jù)庫中的組學(xué)數(shù)據(jù)(比如TCGA、GEO、EBI、SRA、CGGA、PRIDE等)。

            主要內(nèi)容詳細內(nèi)容見下文日程表

            1.多組學(xué)分析常用數(shù)據(jù)庫;

            2.多組學(xué)分析常用軟件和工具;

            3.教授對應(yīng)的圖片制作方法(包含但不限于聚類熱圖、火山圖、富集分析圖、Venn圖、pathwaymap)

            【會議預(yù)期】

            通過三天的學(xué)習(xí),了解多組學(xué)整合分析思路對項目及文章的幫助,以及實操常見的數(shù)據(jù)庫、在線工具和本地軟件。使得學(xué)員可以自己完成一個完整的分析報告并獲得疾病相關(guān)的靶標基因。

            講師簡介

            宋偉博士

            成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。

            研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。

            培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場培訓(xùn)班。



            主辦方:上海循掘生物科技中心

            會議時間2020年7月17-19日(兩天兩晚)

            17日 19:00-20:00

            18日 8:30-18:00 及19:00-20:00

            19日 8:30-17:30

            會議地點醫(yī)藥加ZOOM網(wǎng)絡(luò)會議室

            說明研討會使用專業(yè)會議軟件ZOOM,需提前安裝好

            查看更多

            醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心

            舉辦了2018腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預(yù)測模型構(gòu)建與基于R語言統(tǒng)計分析學(xué)習(xí)班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學(xué)習(xí)班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標書構(gòu)思與撰寫學(xué)習(xí)班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學(xué)SCI論文寫作及發(fā)表技巧學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) ......

            上海遐永醫(yī)藥科技

            南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細胞信號通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。

            上海遐錦生物科技有限公司 上海遐錦生物科技有限公司

            上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。

            會議日程 (最終日程以會議現(xiàn)場為準)


            ?【會議日程】

            日期

            時間

            大綱

            詳細內(nèi)容

            第一天晚上

            19:00-21:00

            第1節(jié):組學(xué)簡介及生信概述

            2019年國自然中組學(xué)相關(guān)項目解讀

            組學(xué)原始數(shù)據(jù)的來源及質(zhì)量判斷

            高通量:測序及芯片介紹——不同組學(xué):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、表觀組學(xué)、順反組學(xué)、宏基因組學(xué)等。

            文獻案例解讀

            21:00-22:00

            第2節(jié):軟件安裝

            R包安裝

            R簡介及R包安裝

            R基礎(chǔ)講解

            R函數(shù)

            R包


            第二天及晚上

            8:30- 10:30

            第3節(jié):組學(xué)公共數(shù)據(jù)庫

            TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介)及數(shù)據(jù)下載

            GEO數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)查找、篩選、數(shù)據(jù)下載

            EBI數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)查找、篩選、數(shù)據(jù)下載

            GEO2R工具使用

            10:30-10:45

            休息

            10:45-12:00


            第4節(jié):轉(zhuǎn)錄組差異基因篩選及功能富集分析

            計算差異基因 -R limma包 或Excel公式

            主成分分析(PCA)圖制作

            聚類熱圖(heatmap)的制作——R pheatmap包

            火山圖(volcanoPlot)——R ggplot2包 或 Excel制作

            箱式圖(代碼 或無代碼制作)

            R clusterProfiler包富集分析

            基因/蛋白功能富集分析——DAVID工具

            功能富集分析 柱狀圖、條形圖、氣泡圖、餅狀圖的R代碼及Excel制作

            12:00-13:30

            午餐及午休

            13:30-17:30

            第5節(jié):多組學(xué)數(shù)據(jù)與臨床預(yù)后分析

            基因突變分析工具——cbioportal

            在線預(yù)后分析工具——Ualcan

            本地生成KM曲線圖——R survival包

            相關(guān)性分析及散點圖制作

            17:30-19:00

            晚餐

            19:00-22:00

            第6節(jié):轉(zhuǎn)錄組與蛋白組整合分析

            Venn 圖制作

            蛋白與蛋白互作關(guān)系預(yù)測——STRING工具

            網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建與美化——cytoscape軟件

            轉(zhuǎn)錄組與蛋白組整合關(guān)聯(lián)分析思路文章實現(xiàn)


            第三天

            8:30-10:00

            第7節(jié):蛋白組與代謝組整合分析

            代謝物功能富集分析——metaboanalyst工具

            KEGG 數(shù)據(jù)庫介紹及使用

            pathway map制作

            蛋白組與代謝組整合分析思路文章實現(xiàn)

            10:00-10:15

            休息

            10:15-12:00

            第8節(jié):全轉(zhuǎn)錄組整合分析

            各類RNA簡介及ceRNA介紹

            miRNA測序報告解讀

            circRNA測序報告解讀

            miRNA分析工具

            lncRNA分析工具

            12:00-13:30

            午餐及午休

            13:30-15:30

            第9節(jié):其他組學(xué)整合思路

            腸道菌群宏基因組與代謝組

            表觀組與轉(zhuǎn)錄組整合

            15:30-15:45

            休息

            15:45-16:00

            總結(jié)

            總結(jié)及答疑

            ?

            通過本次研討會,您將學(xué)會以下作圖:

            查看更多

            會議嘉賓


            即將更新,敬請期待

            參會指南

            會議門票


            收費標準:會務(wù)費:3200元/人

            優(yōu)惠政策:

            1.提前確認報名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學(xué)習(xí)材料

            2.三人組團報名,每人優(yōu)惠100元

            3.四人組團報名,每人優(yōu)惠200元,

            4.六人組團報名繳費,可免1人會務(wù)費!?

            可以開正規(guī)會務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。?

            注意事項:必須攜帶win10以上系統(tǒng)的電腦,現(xiàn)場不得錄音錄像。上課軟件為Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。

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            查看更多

            溫馨提示
            酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
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