腫瘤免疫與新型細(xì)胞死亡課題設(shè)計(jì)及生信分析研討會(huì)

騰訊會(huì)議在線直播 2023年1月14-15日

通過近幾年的國(guó)自然項(xiàng)目以及文獻(xiàn)發(fā)表來看，腫瘤微環(huán)境和新型細(xì)胞死亡方向的研究非常熱門。無論是國(guó)自然資助的數(shù)量和金額，還是Pubmed發(fā)表的文獻(xiàn)都是逐年增加的趨勢(shì)。

腫瘤微環(huán)境（Tumor microenvironment，TME）是由腫瘤細(xì)胞、宿主細(xì)胞（基質(zhì)細(xì)胞和免疫細(xì)胞）、以及相應(yīng)細(xì)胞的分泌產(chǎn)物和細(xì)胞外基質(zhì)（ECM）組成，同時(shí)也可能存在TME的代謝產(chǎn)物和特定的環(huán)境。腫瘤微環(huán)境是腫瘤賴以生存的“土壤”。腫瘤的生長(zhǎng)與轉(zhuǎn)移與周圍環(huán)境息息相關(guān)，腫瘤可以通過釋放細(xì)胞信號(hào)分子影響其微環(huán)境環(huán)境，促進(jìn)腫瘤的血管生成和誘導(dǎo)免疫耐受，而微環(huán)境中的免疫細(xì)胞可影響癌細(xì)胞增長(zhǎng)和發(fā)育。

通過發(fā)揮促腫瘤作用和抗腫瘤作用，浸潤(rùn)腫瘤的免疫細(xì)胞可以深刻影響腫瘤的進(jìn)展以及抗癌治療的成功。因此免疫細(xì)胞浸潤(rùn)是非常重要的研究方向，我們的科研人員開發(fā)了很多實(shí)用的分析數(shù)據(jù)庫和分析工具。

在細(xì)胞死亡方面，除了大家耳熟能詳?shù)募?xì)胞凋亡、壞死性凋亡（necroptosis）、自噬外，一些新型細(xì)胞死亡方式的研究成為國(guó)自然的重要支持方向，包括細(xì)胞焦亡和鐵死亡等。

細(xì)胞焦亡（Pyroptosis）又稱細(xì)胞炎性壞死，是一種程序性細(xì)胞死亡，表現(xiàn)為細(xì)胞不斷脹大直至細(xì)胞膜破裂，導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)容物的釋放進(jìn)而激活強(qiáng)烈的炎癥反應(yīng)。細(xì)胞焦亡是機(jī)體一種重要的天然免疫反應(yīng)，在抗擊感染和激活腫瘤免疫微環(huán)境方面發(fā)揮重要作用。細(xì)胞焦亡是由gasdermin介導(dǎo)的細(xì)胞程序性壞死。

鐵死亡(Ferroptosis)是一種鐵依賴性的調(diào)節(jié)性細(xì)胞死亡方式。鐵死亡的過程很復(fù)雜，由多種代謝物和生物分子組成，其中驅(qū)動(dòng)基因、抑制基因、誘導(dǎo)因子和抑制因子是鐵死亡的調(diào)控因子。鐵死亡的核心標(biāo)志是ROS激活的質(zhì)膜脂質(zhì)過氧化。

怎樣基于自己的測(cè)序數(shù)據(jù)或公共數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)（比如TCGA、GEO、EBI等）進(jìn)行免疫細(xì)胞浸潤(rùn)分析或新型細(xì)胞死亡相關(guān)分析，常用的分析數(shù)據(jù)庫以及分析工具的使用過程實(shí)操及結(jié)果解讀是怎樣的？

培訓(xùn)目標(biāo)：

1. 掌握在腫瘤發(fā)生過程中固有和適應(yīng)性免疫的重塑特點(diǎn)。

2. 詳細(xì)了解腫瘤免疫逃逸的分子過程和分子機(jī)制。

3. 理解新型細(xì)胞死亡特點(diǎn)及其在腫瘤免疫微環(huán)境重塑中的作用。

4. 通過實(shí)例學(xué)習(xí)并掌握TIME課題設(shè)計(jì)思路和研究策略

5.了解最新最熱癌癥分析思路，免疫細(xì)胞浸潤(rùn)及鐵死亡分析參與過程。

6.免疫細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)數(shù)據(jù)庫及工具學(xué)習(xí)（TIMER2.0, CIBERSORT, IMMUPORT, xCELL等）

7.鐵死亡相關(guān)數(shù)據(jù)庫及工具學(xué)習(xí)（FerrDb，KEGG）

8.國(guó)自然及高分文獻(xiàn)中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)及鐵死亡分析相關(guān)圖表生成制作。

講師介紹：

MAO教授，北京大學(xué)博士，斯坦福大學(xué)博士后，歐盟Erasmus+訪問學(xué)者。教授，博士生導(dǎo)師。主要從事腫瘤分子生物學(xué)，藥理學(xué)等研究，在相關(guān)領(lǐng)域取得了令人矚目的成就。在Blood、Cancer Research、Oncogene、Journal of Clinical Investigation、Journal of Biological Chemistry等著名雜志已發(fā)表研究論文60多篇，IF>400。主持重點(diǎn)國(guó)合等項(xiàng)目。評(píng)審重點(diǎn)、重點(diǎn)國(guó)合、優(yōu)青、杰青等不同類型項(xiàng)目，經(jīng)驗(yàn)豐富。

宋偉博士，中國(guó)精準(zhǔn)醫(yī)療學(xué)會(huì)委員。

成果：參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請(qǐng)；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建；完成個(gè)體基因檢測(cè)流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。

研究方向：有近十年的生信分析經(jīng)驗(yàn)，擅長(zhǎng)方向有轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機(jī)理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項(xiàng)目分析思路設(shè)計(jì)以及個(gè)性化分析等，精通perl、R等編程語言。

培訓(xùn)經(jīng)歷：在北京、上海、廣州、沈陽、成都、武漢等城市舉辦過十幾場(chǎng)培訓(xùn)班。培訓(xùn)的對(duì)象有：醫(yī)生、學(xué)生、科研工作者、生信愛好者等。

培訓(xùn)方向：《測(cè)序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學(xué)的魅力》、《生信文章實(shí)例解讀》、《生信與實(shí)驗(yàn)的密切關(guān)系》、《生信與臨床醫(yī)學(xué)的關(guān)系》、《生信實(shí)用工具培訓(xùn)》、《多組學(xué)整合分析流程》、《R語言培訓(xùn)》等

會(huì)議時(shí)間：2023年1月14-15日

會(huì)議地點(diǎn)：騰訊會(huì)議在線直播，會(huì)后主辦方統(tǒng)一提供錄屏復(fù)習(xí)

主辦單位：上海循掘生物科技中心

會(huì)務(wù)費(fèi)用：3000元/人。

3人組團(tuán)，每人優(yōu)惠100元。

4人組團(tuán)，每人優(yōu)惠200元，

5人組團(tuán)，可額外帶一人免費(fèi)注冊(cè)。

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會(huì)議日程安排：

通過本次培訓(xùn)，您將學(xué)會(huì)自己繪制以下圖片（包含但不限于）

示例圖 鐵死亡相關(guān)腫瘤微環(huán)境免疫細(xì)胞

示例圖 腫瘤免疫微環(huán)境

示例圖 細(xì)胞死亡對(duì)腫瘤免疫的影響

示例圖 免疫細(xì)胞浸潤(rùn)分析

示例圖 表達(dá)與預(yù)后關(guān)聯(lián)