2017（第三屆）廣州生物信息學(xué)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班
時(shí)間：2017-11-03 08:00 至 2017-11-07 18:00
地點(diǎn)：廣州
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2017（第三屆）廣州生物信息學(xué)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班 已截止報(bào)名會(huì)議時(shí)間： 2017-11-03 08:00至 2017-11-07 18:00結(jié)束 會(huì)議地點(diǎn)： 廣州 暨南大學(xué) 廣東省廣州市黃埔大道西601號(hào) 周邊酒店預(yù)訂 會(huì)議規(guī)模：40人 主辦單位： 北京中科云暢應(yīng)用技術(shù)研究院 |
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會(huì)議通知
會(huì)議內(nèi)容 主辦方介紹
2017（第三屆）廣州生物信息學(xué)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班宣傳圖
? 隨著新一代高通量測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展，在準(zhǔn)確度大大提高的前提下,?進(jìn)一步降低測(cè)序成本。由此不斷產(chǎn)生出巨量的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)有著數(shù)量巨大、關(guān)系復(fù)雜的特點(diǎn)，以至于不利用計(jì)算機(jī)根本無法實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和分析。隨著生物信息學(xué)作為新興學(xué)科迅速蓬勃發(fā)展，正在改變?nèi)藗冄芯可镝t(yī)學(xué)的傳統(tǒng)方式，高通量測(cè)序技術(shù)以及數(shù)據(jù)分析技術(shù)已成為探索生物學(xué)底層機(jī)制和研究人類復(fù)雜疾病診斷、治療及預(yù)后的重要工具，廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)各個(gè)領(lǐng)域，是21世紀(jì)生命科學(xué)與生物技術(shù)的重要戰(zhàn)略前沿和主要突破口。為進(jìn)一步推動(dòng)我國(guó)生物信息學(xué)特別是基因組學(xué)的發(fā)展，提高從業(yè)人員的技術(shù)水平，由北京中科云暢應(yīng)用技術(shù)研究院與中科院北京基因組研究所基因組科學(xué)與信息重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合舉辦“高通量測(cè)序應(yīng)用最新技術(shù)與數(shù)據(jù)分析”高級(jí)培訓(xùn)班，并由北京中科潤(rùn)開生物科技有限公司具體承辦，具體事宜通知如下：
一、培訓(xùn)目標(biāo)及特點(diǎn)：
本培訓(xùn)以第三代測(cè)序、第四代測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用與數(shù)據(jù)分析、基因組、轉(zhuǎn)錄組為主題，精心設(shè)計(jì)了具有前沿性、實(shí)用性和針對(duì)性強(qiáng)的理論課程和上機(jī)課程。培訓(xùn)邀請(qǐng)的主講人均是有理論和實(shí)際研究經(jīng)驗(yàn)的人員。學(xué)員通過與專家直接交流，能夠分享到這些頂尖學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的研究經(jīng)驗(yàn)和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路。學(xué)員通過集中專題學(xué)習(xí)后能夠擴(kuò)展思路，在研究技術(shù)方面領(lǐng)悟更多。
二、培訓(xùn)對(duì)象：
大中專院校生物信息、生物計(jì)算、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)類專業(yè)的課程負(fù)責(zé)人、一線教師、教研室骨干人員、教學(xué)管理人員；科研單位從事生物、生命科學(xué)、微生物研究的相關(guān)人員；生物、醫(yī)藥、化學(xué)及相關(guān)企業(yè)的領(lǐng)導(dǎo)與技術(shù)骨干。
三、時(shí)間地點(diǎn)：2017年11月3日——11月7日 ???廣州
? ? ? ? ?（時(shí)間安排：第1天報(bào)到，授課4天）
四、 培訓(xùn)內(nèi)容
????章節(jié) | ???內(nèi) 容 |
生物信息學(xué)介紹? | 生物信息學(xué)介紹與前沿技術(shù)動(dòng)態(tài) |
序列的比對(duì) | 1、全局比對(duì) ?Clustalw,Muscle,Hmmer 2、局部比對(duì) ?Blast, Sim4,Genewise 3、序列比對(duì)算法分析 |
基因組/基因注釋分析 | 1、新一代測(cè)序技術(shù)原理和數(shù)據(jù)處理介紹 2、基因組拼接與組裝 基因組de novo組裝方法 重復(fù)序列分析技術(shù) 3、 RNA分析 RNA干擾，SiRNA預(yù)測(cè)技術(shù) |
基因組學(xué)研究概述 | 1、structural genomics: 結(jié)構(gòu)基因組學(xué) 2、functional genomics: 功能基因組學(xué) 3、Drug discovery: 藥物研發(fā) 4、Personalized medicine：個(gè)性化、精細(xì)醫(yī)療 |
DNA測(cè)序技術(shù)-轉(zhuǎn)錄組分析的進(jìn)化 | 1、第一代測(cè)序技術(shù)：Sanger測(cè)序原理 2、第二代測(cè)序技術(shù)：Illumina，454, Ion Torrent原理 3、第三代測(cè)序技術(shù)：PacBio, Hellicos原理 4、第四代測(cè)序技術(shù): Oxford NanoPore原理 5、其他技術(shù)Hybridization based methods (NabSys) |
Experimental ??procedure for transcriptomic analysis | Introduction Number of duplications Sequencing coverage Transcriptomic analysis using NGS (RNA-Seq) Transcriptomic analysis using PacBio (Iso-Seq) IsoSeq Experimental design |
Data analysis ?（part 1）：data pre-processing | evaluation of data quality 數(shù)據(jù)分析 Data format，fasta，fastq，quality value，gff3?Data cleanup Quality filter, trimmer, clipper |
Data analysis （part 2）：reference free analyses（無參轉(zhuǎn)錄組分析） | Gene discovery Trinity de novo transcriptome assembly Analysis of Differential Expressed Gene （DEGs） Abundance estimation using RSEM Differential expression analysis using EdgeR Explore the results (cummerbund) MA plot, Volcano plot, False Discovery Rate (FDR) hierarchical two-way clustering, pairwise sample-distance,?gene expression profiles. |
使用R語言進(jìn)行生物信息學(xué)相關(guān)的分析 | 使用R語言相關(guān)的包對(duì)轉(zhuǎn)錄組等組學(xué)的高通量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行差異表達(dá)、富集分析等。 生物信息學(xué)專業(yè)圖KEGG、GO等的繪制方法與運(yùn)用R語言進(jìn)行實(shí)現(xiàn) |
基因組可視化軟件circos的使用 | 使用circos繪制基因組圈圖 |
生物信息學(xué)專業(yè)常用工具及繪圖方法 | 應(yīng)用生物信息常用的工具進(jìn)行專業(yè)繪圖及格式轉(zhuǎn)換； 學(xué)BioEdit、WeGO等常用生物學(xué)專業(yè)軟件的圖表及格式轉(zhuǎn)換 |
五、主講專家：
主講專家來自中科院等科研機(jī)構(gòu)的高級(jí)專家，擁有豐富的科研及工程技術(shù)經(jīng)驗(yàn)，長(zhǎng)期從事生物信息領(lǐng)域項(xiàng)目研究，具有資深的技術(shù)底蘊(yùn)和專業(yè)背景。
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會(huì)議日程
會(huì)議嘉賓
參會(huì)指南
會(huì)議門票 場(chǎng)館介紹
每人￥4300元（含報(bào)名費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、考試費(fèi)、證書費(fèi)），食宿可統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。請(qǐng)各有關(guān)部門統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報(bào)名參加培訓(xùn)，各單位也可直接報(bào)名參加。
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溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動(dòng)延期或取消，建議“異地客戶”與活動(dòng)家客服確認(rèn)參會(huì)信息后，再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動(dòng)各項(xiàng)資源需提前采購，購票后不支持退款，可以換人參加。
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