復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院位于上海市楓林路180號(hào)/斜土路1609號(hào)/松江區(qū)佘山鎮(zhèn)劉家山村456號(hào)/醫(yī)學(xué)院路111號(hào)，占地面積95892.1平方米，總建筑面積338732平方米，始建于1937年，是一所三級(jí)綜合醫(yī)院，是上海市醫(yī)保定點(diǎn)單位。醫(yī)院設(shè)有感除兒科以外的所有科室。其中，國家臨床重點(diǎn)專科18個(gè)（消化科、檢驗(yàn)科、麻醉科、心血管內(nèi)科、內(nèi)分泌科、胸外科、心臟大血管外科、臨床護(hù)理、中醫(yī)腦病科、呼吸內(nèi)科、腎病科、普通外科、重癥醫(yī)學(xué)科、腫瘤科、醫(yī)學(xué)影像科、器官移植科、急診醫(yī)學(xué)科和神經(jīng)內(nèi)科）。另外，上海市心血管病研究所、復(fù)旦大學(xué)肝癌研究所、上海市影像醫(yī)學(xué)研究所、上海市呼吸病研究所、上海市中西醫(yī)結(jié)合康復(fù)研究所、上海市肝病研究所、上海市腎病與透析研究所、上海市臨床生物信息學(xué)研究所、復(fù)旦大學(xué)呼吸病研究所、復(fù)旦大學(xué)血管外科研究所、復(fù)旦大學(xué)普通外科研究所、復(fù)旦大學(xué)內(nèi)鏡診療研究所、復(fù)旦大學(xué)核醫(yī)學(xué)研究所、復(fù)旦大學(xué)超聲醫(yī)學(xué)與工程研究所、復(fù)旦大學(xué)慢性代謝性疾病研究所設(shè)在醫(yī)院。

轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)（Translational Medicine）不是單一的學(xué)科或是技術(shù)，更多地是一種轉(zhuǎn)化的狀態(tài)，即指從實(shí)驗(yàn)室到臨床（bench to bedside）、從臨床到實(shí)驗(yàn)室（bedside to bench）。 ??轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)不是簡(jiǎn)單地所基礎(chǔ)研究成果放到臨床來，它還意味著整個(gè)醫(yī)學(xué)模式的轉(zhuǎn)變。這種新的醫(yī)學(xué)模式是將預(yù)測(cè)、預(yù)防、早期干預(yù)和個(gè)體化治療作為將來臨床醫(yī)學(xué)發(fā)展的方向。 ??轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)具有豐富的內(nèi)涵，它通過現(xiàn)代分子生物技術(shù)等各種方法將實(shí)驗(yàn)室研究成果轉(zhuǎn)化為臨床應(yīng)用的產(chǎn)品與技術(shù)，同時(shí)通過臨床的觀察與分析幫助實(shí)驗(yàn)室更好的認(rèn)識(shí)人體與疾病、進(jìn)行更優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)來促進(jìn)基礎(chǔ)研究，從而最終實(shí)現(xiàn)整體醫(yī)療水平的提高、幫助患者解決健康問題。目前的新藥研發(fā)、醫(yī)療器械、醫(yī)療APP、分子診斷等都屬于轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的范疇

上海市臨床生物信息研究所的目標(biāo)為成為國內(nèi)外臨床生物信息學(xué)界進(jìn)行高層次學(xué)術(shù)交流的窗口和基地；引領(lǐng)臨床生物信息學(xué)研究和發(fā)展，促進(jìn)疾病特異性臨床生物信息學(xué)的發(fā)展。臨床生物信息學(xué)是結(jié)合海量的生物信息與動(dòng)態(tài)的臨床信息，利用生物信息學(xué)和生物統(tǒng)計(jì)學(xué)等信息處理工具和能力，研究和揭示疾病發(fā)展和個(gè)體化治療的疾病本質(zhì)，實(shí)現(xiàn)生物信息學(xué)與具體醫(yī)學(xué)應(yīng)用的有效結(jié)合。上海市臨床生物信息研究所是依托單位為復(fù)旦大學(xué)和中山醫(yī)院在復(fù)旦大學(xué)臨床生物信息中心的基礎(chǔ)上建立的。服務(wù)于上海市臨床醫(yī)學(xué)和疾病特異性生物信息學(xué)的信息化建設(shè)，服務(wù)于上海市醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的信息化工程建設(shè)，并努力積極承擔(dān)國家科技計(jì)劃，實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化。

復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院是國家衛(wèi)生健康委員會(huì)委屬事業(yè)單位，是復(fù)旦大學(xué)附屬的綜合性教學(xué)醫(yī)院。醫(yī)院開業(yè)于1937年，是當(dāng)時(shí)最早由中國人創(chuàng)建和管理的大型綜合性醫(yī)院之一，隸屬于國立上海醫(yī)學(xué)院，為紀(jì)念中國民主革命的先驅(qū)孫中山先生而命名。解放后曾稱上海第一醫(yī)學(xué)院附屬中山醫(yī)院和上海醫(yī)科大學(xué)附屬中山醫(yī)院，2001年改用現(xiàn)名，沿用至今，是上海市第一批三級(jí)甲等醫(yī)院。

中國科學(xué)院系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室成立于2006年。實(shí)驗(yàn)室依托：中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院。 系統(tǒng)生物學(xué)是21世紀(jì)生命科學(xué)的一門新興學(xué)科，也是在經(jīng)典實(shí)驗(yàn)生物學(xué)、生物大科學(xué)、系統(tǒng)科學(xué)和計(jì)算數(shù)學(xué)等基礎(chǔ)上形成的一門交叉科學(xué)。系統(tǒng)生物學(xué)一方面包括了經(jīng)典實(shí)驗(yàn)生物學(xué)和各種"組學(xué)"研究平臺(tái)，另一方面還需要計(jì)算科學(xué)、數(shù)學(xué)等理論科學(xué)方面的理論和工具。系統(tǒng)生物學(xué)的主要研究目標(biāo)是復(fù)雜的生命活動(dòng)如細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和個(gè)體發(fā)育，以及危害人類健康的復(fù)雜性疾病，如腫瘤、糖尿病和神經(jīng)退行性疾病。

復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院位于上海市楓林路180號(hào)/斜土路1609號(hào)/松江區(qū)佘山鎮(zhèn)劉家山村456號(hào)/醫(yī)學(xué)院路111號(hào)，占地面積95892.1平方米，總建筑面積338732平方米，始建于1937年，是一所三級(jí)綜合醫(yī)院，是上海市醫(yī)保定點(diǎn)單位。

2018年12月4日，被國家衛(wèi)健委公布為首批腫瘤多學(xué)科診療試點(diǎn)醫(yī)院。