目前主持清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息學(xué)研究室的工作，并聯(lián)合成立了跨系、跨學(xué)科的生物信息學(xué)研究所和教育部生物信息學(xué)重點實驗室，任教育部生物信息學(xué)重點實驗室常務(wù)副主任。 　　開設(shè)的課程：生物物理（本科生,與隋森芳教授合講），1994—2009年；功能基因組信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)（研究生），1999—2009年。主要研究領(lǐng)域是基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)與生物信息學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)。目前正圍繞功能基因組信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)開展基礎(chǔ)和應(yīng)用研究。研究課題包括:從基因組到蛋白質(zhì)組結(jié)構(gòu)、功能的分子生物學(xué)遺傳信息的多層次研究，以及從分子到細(xì)胞、到復(fù)雜疾病的綜合分析的系統(tǒng)生物學(xué)研究。1)基于序列的蛋白質(zhì)功能研究 孫之榮,華蘇軍,張松,過濤,周云等，2008年教育部自然科 學(xué)二等獎。 　　2)清華大學(xué)“紀(jì)念梅貽琦學(xué)術(shù)論文基礎(chǔ)研究獎” 二等獎三次，2006、2007、2008年。 　　3)清華大學(xué)基礎(chǔ)科學(xué)研究獎，1998年。 　　現(xiàn)任中國生物物理學(xué)會、中國細(xì)胞生物學(xué)會、中國生物化學(xué)學(xué)會會員；中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會功能基因組信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)分會會長；北京系統(tǒng)工程學(xué)會理事；“生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展”、“生物物理學(xué)報”編委；? editorial board of "Journal of Biomedicine and Biotechnology."