TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2019（12月北京班）
時間：2019-12-13 08:00 至 2019-12-15 18:00
地點：北京
- 參會報名
- 會議介紹
- 會議日程
- 會議嘉賓
- 參會指南
-
手機下單
首頁 > 商務會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2019（12月北京班） 更新時間：2019-12-13T17:58:24
(點擊可切換)
|
TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2019（12月北京班） 已截止報名會議時間： 2019-12-13 08:00至 2019-12-15 18:00結束 會議地點： 北京 北京金泰綠洲酒店 北京 東城區(qū) 永外彭莊甲58號（近北京南站） ，近陶然橋西南角。 周邊酒店預訂 主辦單位： 上海遐永醫(yī)藥科技 |
收藏3人
換一換
會議介紹
會議內容 主辦方介紹
TCGA&GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘分析研討會2019（12月北京班）宣傳圖
背景簡介：
2019年度國家自然基金醫(yī)學科學部共批資助10138項目，批助金額總計441310萬元。其中面上項目數(shù)量占45%，金額占57%；青年科學基金項目數(shù)量占43%，金額占20%。
初步統(tǒng)計，這些項目中大部分都與編碼基因有直接或間接的關聯(lián)。其中，與通路（pathway）關聯(lián)的有1349項，金額4.89億；與miRNA相關的有630項，金額2.3億；與lncRNA相關的有395項，金額1.45億；?
如何獲得有創(chuàng)新意義的疾病靶標基因（mRNA，Protein，lncRNA，circRNA，miRNA，Mutation等）是項目申請及文章寫作時最常見的問題?；谶@個目的，我們開展了該培訓班：TCGA&GEO高通量數(shù)據(jù)挖掘。
癌癥是臨床醫(yī)學中非常重要的疾病方向。TCGA數(shù)據(jù)庫中包含了常見了40種癌癥方向（含30000個樣本）的高通量數(shù)據(jù)及臨床信息。大家對TCGA數(shù)據(jù)庫的使用近幾年也在逐漸增加！另外，其他疾病的研究可以通過GEO數(shù)據(jù)庫進行。
項目類型 | 題目 | 金額/萬元 |
重點項目 | FXYD3介導的信號網(wǎng)絡對腸道黏膜免疫穩(wěn)態(tài)的調控研究 | 300 |
重點項目 | 基于蛋白-蛋白相互作用精準調節(jié)轉錄因子Nrf2活性及探索其作為肝細胞癌治療的新靶標 | 298 |
重點項目 | miR-23b/24-1簇防治燒傷后膿毒癥所致MODS的系統(tǒng)研究 | 297 |
面上項目 | LZTR1基因突變導致的RAS/MAPK通路過度激活以及Noonan綜合征相關肥厚型心肌病的機制研究 | 60 |
面上項目 | SUGP2基因及其突變在遺傳性血色病中的致病作用及其機制研究 | 60 |
面上項目 | WDR73基因突變在Galloway-Mowat綜合征中的致病機制研究 | 60 |
面上項目 | STAG2通過ERK/AKT/GSK3β/c-Myc反饋通路調節(jié)甲狀腺癌谷氨酰胺代謝的機制研究 | 60 |
面上項目 | LncRNA FOXF1靶向調控動力相關蛋白1表達在缺氧誘發(fā)肺動脈內皮細胞焦亡中的作用及分子機制 | 55 |
會議預期：
通過三天的學習，我們了解生信分析思路對項目及文章的幫助，以及實操常見的數(shù)據(jù)庫、在線工具和本地軟件。使得學員可以自己完成一個完整的分析報告并獲得疾病相關的靶標基因。
主辦方：上海遐永醫(yī)藥科技有限公司
會議時間：2019年12月13-15日（三天），12日可報到（下午3點-晚上9點）
上課時間：上午9：00-12：00，下午1：30-6：00
會議地點：金泰綠洲酒店??北京市東城區(qū)永外彭莊甲58號
推薦住宿金泰綠洲酒店，普通房398元，豪華房498房 住宿自理
通過本次學習，您可以學會以下作圖（包括但不限于）
查看更多
南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd），是專一服務于生命科學研究的專業(yè)技術型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè)，從事生物技術產(chǎn)品的開發(fā)及銷售，致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術產(chǎn)品供應商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質、合理價格、專業(yè)服務，是我們?yōu)槟盏淖谥?。在細胞信號通路、免疫學、蛋白組學上擁有顯著優(yōu)勢，其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學科研工作者提供了極大的便利。
會議日程
（最終日程以會議現(xiàn)場為準）
TCGA&GEO高通量數(shù)據(jù)挖掘分析實操強化研討會 | |||
時間安排 | 課程表 | 介紹 | |
第一天 | 9:00~10:30 | 生信簡介 | 生物信息介紹 |
高通量：測序及芯片介紹——不同組學：轉錄組學、基因組學、表觀組學、 順反組學、宏基因組學等。 | |||
經(jīng)典生信SCI文章的解讀，了解TCGA數(shù)據(jù)庫、 GEO 數(shù)據(jù)庫這些公共數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結論并發(fā)文章的思路。 | |||
10:45-12:00 | TCGA數(shù)據(jù)庫 NCBI GEO數(shù)據(jù)庫 | TCGA數(shù)據(jù)庫：最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介) | |
TCGA數(shù)據(jù)庫的介紹和使用（包含了轉錄組、基因組、表觀組和臨床信息數(shù)據(jù)） | |||
GEO數(shù)據(jù)庫介紹：?數(shù)據(jù)量最大的高通量公共數(shù)據(jù)庫。 | |||
GEO數(shù)據(jù)庫的高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉換、差異分析等。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
13:30~15:00 | R語言學習 | R軟件與Rstudio軟件下載、安裝、界面。 R語言基礎：元素、向量、矩陣、數(shù)組 R語言函數(shù)：計算函數(shù)、統(tǒng)計函數(shù)等 R語言路徑確認及修改 R語言文件（圖、表）的導入和導出 | |
15:20~17:00 | R語言學習 | R語言包：包的下載安裝 R語言：差異分析limma包使用、火山圖制作 | |
第二天 | 8:30~10:00 | TCGA相關的下載工具 | TCGA數(shù)據(jù)庫癌癥數(shù)據(jù)下載：RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、 甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載 |
10:20~12:00 | TCGA相關的分析工具 | TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關聯(lián)分析、 生存分析、miRNA調控靶基因分析等。 | |
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
13:30~17:00 | 數(shù)據(jù)的后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) | DAVID功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 | |
通路map圖構建 | |||
聚類熱圖制作 R語言pheatmap包做聚類熱圖 | |||
蛋白與蛋白互作分析（PPI）——STRING數(shù)據(jù)庫 | |||
第三天 | 8:30~12:00 | 數(shù)據(jù)的后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) | cytoscape軟件（上）：網(wǎng)絡圖構建與美化 |
cytoscape軟件（下）：插件使用 | |||
GSEA軟件的實操：全基因集富集分析 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
13:30~16:00 | 思路討論 | 基于GEO數(shù)據(jù)庫多套數(shù)據(jù)整合（meta）分析思路演練 | |
基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉錄組整合分析思路演練 | |||
基于TCGA的甲基化與轉錄組整合分析思路演練 | |||
基于TCGA的基因組與轉錄組整合分析思路演練 | |||
串講 | 思路大串講 | ||
備注：講師使用windows10系統(tǒng)講解，建議攜帶同樣系統(tǒng)的電腦 | |||
上課軟件為：Cytoscape，Heml，GSEA，R和Rstudio | |||
查看更多
會議嘉賓
（最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準）
講師簡介：宋偉博士
成果：參與完成了近百篇軟件著作權和發(fā)明專利的撰寫和申請；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構建；完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向：有近十年的生信分析經(jīng)驗，擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯(lián)分析、項目分析思路設計以及個性化分析等，精通perl、R等編程語言。
培訓經(jīng)歷：在上海、北京、廣州、沈陽、南京等城市舉辦過幾十場培訓班。
查看更多
參會指南
會議門票 場館介紹
收費標準：會務費：3800元每位（會務費包含電子版教材、午餐，住宿費自理。）
優(yōu)惠政策：
1.提前確認報名及轉賬的，可以提前拿到學習材料
2.三人組團報名，每人優(yōu)惠100元
3.四人組團報名，每人優(yōu)惠200元，
4.六人組團報名繳費，可免1人參會費！?
可以開正規(guī)會務發(fā)票，紙質邀請函（蓋紅章）。?
注意事項：必須攜帶win7以上系統(tǒng)的電腦，現(xiàn)場不得錄音錄像。上課軟件為Cytoscape，Heml，GSEA，R和Rstudio。
查看更多
北京金泰綠洲酒店
交通指南：
前門、崇文門商貿區(qū)
駕車距離4.3公里（約10分鐘）
永定門、南站、大紅門、南苑地區(qū)
駕車距離1.5公里（約4分鐘）
南苑機場
駕車距離11.0公里（約19分鐘）
首都國際機場
駕車距離34.3公里（約42分鐘）
北京火車站
駕車距離7.6公里（約15分鐘）
北京西站
駕車距離11.0公里（約19分鐘）
市中心
駕車距離6.0公里（約14分鐘）
故宮
駕車距離6.8公里（約14分鐘）
天安門廣場
駕車距離5.7公里（約12分鐘）
北京金泰綠洲大酒店地處南二環(huán)陶然橋西南側，毗鄰陶然亭公園、天安門、天壇等旅游景點，緊鄰北京南站，交通便利。
北京金泰綠洲大酒店內設標準配備的各類客房，房內提供的寬帶上網(wǎng)、全套的現(xiàn)代化設備、中央空調和自動消防系統(tǒng)，讓您盡享舒適、安全的休憩環(huán)境。
酒店餐廳不僅提供山西風味菜肴，還為您奉上川、魯、粵等風味菜肴，讓您齒頰留香、回味無窮。酒店擁有一個可容納150-220人的多功能廳及多種專業(yè)會議室，為您的會議和培訓提供良好的辦公環(huán)境。
溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消，建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后，再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購，購票后不支持退款，可以換人參加。
您可能還會關注
-
2025（第八屆）多組學研究與臨床轉化前沿論壇
2025-06-27 上海
-
2025中國研究型醫(yī)院大會
2025-07-18 濟南
-
第26屆眼底病學術交流會議暨國際視網(wǎng)膜研討會（Retina China 2025）
2025-06-04 北京
-
2025年DIA藥物信息大會暨展覽會
2025-05-19 上海
贊助
