2019全國TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班(4月北京班)
時間:2019-04-27 08:00 至 2019-04-28 18:00
地點:北京

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首頁 > 商務(wù)會議 > 醫(yī)療醫(yī)學(xué)會議 > 2019全國TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班(4月北京班) 更新時間:2019-03-20T14:24:55
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![]() 2019全國TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班(4月北京班) 已截止報名會議時間: 2019-04-27 08:00至 2019-04-28 18:00結(jié)束 會議地點: 北京 北京金泰綠洲大酒店 北京市東城區(qū)永外彭莊甲58號(陶然橋西南角) 周邊酒店預(yù)訂 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技 醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心 上海遐錦生物科技有限公司
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會議介紹
會議內(nèi)容 主辦方介紹

2019全國TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班(4月北京班)宣傳圖
培訓(xùn)簡介:
癌癥是臨床醫(yī)學(xué)中非常重要的疾病方向。TCGA數(shù)據(jù)庫中包含了常見了40種癌癥方向(含30000個樣本)的高通量數(shù)據(jù)及臨床信息。大家對TCGA數(shù)據(jù)庫的使用近幾年也在逐漸增加!如圖1所示。
圖1 基于 pubmed數(shù)據(jù)庫檢索的包含“TCGA”發(fā)表的SCI 文章數(shù)量(2018年11月7日)
關(guān)鍵靶標分析是指基于生信的方法從高通量數(shù)據(jù)中挖掘到與研究方向最相關(guān)的靶標基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。
因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力以及邏輯性的生信分析思路,從海量信息中獲得自己想要的關(guān)鍵基因!
培訓(xùn)預(yù)期:
1. 通過整整兩天的培訓(xùn),掌握TCGA,GEO數(shù)據(jù)庫的使用、下載及分析思路和實用操作知識點。
2. 可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
3. 課后還可以贈送1小時的全場串聯(lián)視頻,用于學(xué)員的復(fù)習(xí)。
4. 贈送一份最近5年的高價值國自然標書(醫(yī)藥加高價值標書庫里面選擇)
5. 講師團隊贈送TCGA數(shù)據(jù)庫甲基化,基因表達譜整合分析報告與疾病mRNA+lncRNA分析報告
學(xué)習(xí)班組織方
主辦方:醫(yī)藥加科研培訓(xùn)中心
承辦方:上海遐永醫(yī)藥科技有限公司
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細胞信號通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。

舉辦了2018腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預(yù)測模型構(gòu)建與基于R語言統(tǒng)計分析學(xué)習(xí)班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學(xué)習(xí)班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學(xué)國自然課題設(shè)計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標書構(gòu)思與撰寫學(xué)習(xí)班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學(xué)SCI論文寫作及發(fā)表技巧學(xué)習(xí)班2019(1月上海班) ......

上海遐錦生物科技有限公司于2019年11月29日舉辦全國循證醫(yī)學(xué)Meta分析與網(wǎng)狀Meta研討會2019(11月上海班)會議。
會議日程
(最終日程以會議現(xiàn)場為準)
TCGA&GEO高通量數(shù)據(jù)挖掘分析班課表 | |||
日期 | 時間 | 課程安排 | 內(nèi)容介紹 |
第 一 天 上 午 | 9:00-10:00 | 生信簡介 | 生物信息介紹 |
高通量:測序及芯片介紹——多組學(xué):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、表觀組學(xué)、宏基因組學(xué)等 | |||
經(jīng)典生信SCI文章的思路解讀,了解TCGA數(shù)據(jù)庫、GEO數(shù)據(jù)庫及高通量測序數(shù)據(jù)的挖掘獲得創(chuàng)新結(jié)論并發(fā)文章的思路 | |||
10:00-10:15 | 茶歇 | ||
10:15-12:00 | TCGA數(shù)據(jù)庫 NCBI GEO數(shù)據(jù)庫 | TCGA數(shù)據(jù)庫:最全的癌癥高通量數(shù)據(jù)公共庫(簡介) | |
TCGA數(shù)據(jù)庫的產(chǎn)生過程 | |||
TCGA官方數(shù)據(jù)庫的介紹和使用(包含了轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀組和臨床信息數(shù)據(jù)) | |||
GEO數(shù)據(jù)庫介紹及使用:高通量芯片數(shù)據(jù)查找、篩選、探針轉(zhuǎn)換、差異分析等。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第 一 天 下 午 | 13:30-15:00 | TCGA相關(guān)下載工具 | TCGA數(shù)據(jù)庫據(jù)下載:RNA-seq數(shù)據(jù)、miRNA-seq數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)的下載TCGA數(shù)據(jù)書庫癌癥數(shù)據(jù)的處理,獲得關(guān)鍵mRNA、miRNA的表達譜矩陣。 |
15:00-15:20 | 茶歇 | ||
15:20-17:00 | TCGA相關(guān)分析工具 | TCGA數(shù)據(jù)分析——突變分析、差異分析、關(guān)聯(lián)分析、生存分析、miRNA調(diào)控靶基因分析等。 | |
獲得生存曲線圖(KM曲線,分為臨床因素和基因表達兩種KM曲線) | |||
第 二 天 上 午 | 8:30-10:30 | TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) | 功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 |
聚類熱圖制作 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | TCGA數(shù)據(jù)后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) | 蛋白互作分析(PPI)及網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建 | |
網(wǎng)絡(luò)分析及hub蛋白/基因獲得。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周 日 下 午 | 13:30-15:00 | TCGA數(shù)據(jù)庫與GEO數(shù)據(jù)庫挖掘 | 基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 基于TCGA的甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練 基于GEO數(shù)據(jù)庫多套數(shù)據(jù)整合(meta)分析思路演練 |
15:00-15:20 | |||
15:20-16:30 | 整體演練并錄屏 | 在電腦上快速完成從頭到尾的一套數(shù)據(jù)實戰(zhàn),及答疑 | |
注意事項:學(xué)員需自己帶電腦,要求為windows系統(tǒng),現(xiàn)場不得錄音錄像,上課所用軟件為cytoscape和Heml |
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會議嘉賓
(最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準)
講師簡介
宋偉博士
成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。
培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、沈陽、濟南、武漢等城市舉辦過十幾場培訓(xùn)班。培訓(xùn)的對象有:醫(yī)生、學(xué)生、科研工作者、生信愛好者等。
培訓(xùn)方向:《測序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學(xué)的魅力》、《生信文章實例解讀》、《生信與實驗的密切關(guān)系》、《生信與臨床醫(yī)學(xué)的關(guān)系》、《生信實用工具培訓(xùn)》、《多組學(xué)整合分析流程》、《R語言培訓(xùn)》等
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參會指南
會議門票 場館介紹
學(xué)習(xí)費2800元每位(學(xué)習(xí)費包含電子版教材、午餐,住宿費自理,保證學(xué)員完全掌握。)
優(yōu)惠政策:
1. 提前支付轉(zhuǎn)賬的可提前拿到學(xué)習(xí)資料
2. 三人組團報名,每人收費2700元
3. ?四人組團報名,每人收費2600元
4. ?五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!?
5. 參加過醫(yī)藥加測序與芯片數(shù)據(jù)挖掘的學(xué)員只要再支付1400元
可以開正規(guī)會務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。?
注意事項:攜帶windows系統(tǒng)的電腦,蘋果電腦請務(wù)必提前做好雙系統(tǒng)。現(xiàn)場不得錄音錄像。
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交通指南:
前門、崇文門商貿(mào)區(qū)駕車距離4.2公里(約18分鐘)、
永定門、南站、大紅門、南苑地區(qū)駕車距離1.5公里(約5分鐘)、
南苑機場駕車距離12.7公里(約33分鐘)
北京金泰綠洲大酒店地處南二環(huán)陶然橋西南側(cè),毗鄰陶然亭公園、天安門、天壇等旅游景點,緊鄰北京南站,交通便利。
北京金泰綠洲大酒店內(nèi)設(shè)標準配備的各類客房,房內(nèi)提供的寬帶上網(wǎng)、全套的現(xiàn)代化設(shè)備、中央空調(diào)和自動消防系統(tǒng),讓您盡享舒適、安全的休憩環(huán)境。
酒店餐廳不僅提供山西風(fēng)味菜肴,還為您奉上川、魯、粵等風(fēng)味菜肴,讓您齒頰留香、回味無窮。酒店擁有一個可容納150-220人的多功能廳及多種專業(yè)會議室,為您的會議和培訓(xùn)提供良好的辦公環(huán)境。
溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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