2018測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班(9月南京班)
時間:2018-09-29 08:00 至 2018-09-30 18:00
地點:南京

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首頁 > 商務(wù)會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > 2018測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班(9月南京班) 更新時間:2018-07-09T17:23:21
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![]() 2018測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班(9月南京班) 已截止報名會議時間: 2018-09-29 08:00至 2018-09-30 18:00結(jié)束 會議地點: 南京 詳細地址會前通知 周邊酒店預(yù)訂 會議規(guī)模:50人 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技
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會議介紹
會議內(nèi)容 主辦方介紹

2018測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班(9月南京班)宣傳圖
【醫(yī)藥加】測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班
生物信息學(bioinformatics)定義:是在大分子方面的概念型的生物學,并且使用了信息學的技術(shù),這包括了從應(yīng)用數(shù)學、計算機科學以及統(tǒng)計學等學科衍生而來各種方法,并以此在大尺度上來理解和組織與生物大分子相關(guān)的信息。
生物信息學魅力:
幫助預(yù)測疾病相關(guān)的潛在基因,以及該基因潛在的作用靶點、上游調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子等,從而指導(dǎo)實驗方向、縮小試驗范圍、簡化試驗流程。
為基金申請?zhí)峁┲С?,通過強大的信息數(shù)據(jù)的收集整理,減少投入增強研究目的性;且通過整合技術(shù)優(yōu)勢,指導(dǎo)提高臨床診斷水平。
豐富的免費的數(shù)據(jù)資源和生物軟件工具:數(shù)據(jù)庫:NCBI, EBI, DDBJ, PDB,SWISS-PROT等;軟件工具:Cytoscape,BLAST,? R語言,String,? David等。
本次培訓(xùn)目的:
很多老師都做過測序或者芯片實驗,雖然測序公司已經(jīng)給出了一部分的數(shù)據(jù)分析,比如過濾、質(zhì)控、比對、定量和差異等,但是這些分析屬于基礎(chǔ)傻瓜式的標準分析,并不能完整的講一個故事!因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力,從海量信息中獲得自己想要的關(guān)鍵基因!
培訓(xùn)預(yù)期:
通過2天的培訓(xùn),使學員掌握生信文獻分析思路和8個實用操作知識點(具體見最后),可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
通過2天的學習,我們可以掌握一篇生信SCI文獻的所有分析模塊,并可以獨立的結(jié)合自己的研究方向進行生信分析和數(shù)據(jù)挖掘,獲得一套屬于自己的分析結(jié)果。
學習班時間與地點(上海班)
上海班 ??培訓(xùn)時間:2018年5月26-27日?、8月4-5日、11月17-18日
培訓(xùn)地點:?上海好望角大飯店?? 上海市肇嘉浜路500號
北京班 ?培訓(xùn)時間:2018年7月14-15日、9月15-16日
培訓(xùn)地點:北京金泰綠洲大酒店 ?北京市東城區(qū)永外彭莊甲58號
廣州班 ?培訓(xùn)時間:8月18-19日
培訓(xùn)地點:廣州凱榮都國際大酒店 廣州市海珠區(qū)江海大道3號
南京班:培訓(xùn)時間:9月29-30日
深圳班:培訓(xùn)時間:12月29-30日
學習辦主辦:醫(yī)藥加學習班
學習班承辦方:上海遐永醫(yī)藥科技
學習班贊助方:爾云生信
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務(wù)于生命科學研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細胞信號通路、免疫學、蛋白組學上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學科研工作者提供了極大的便利。
會議日程
(最終日程以會議現(xiàn)場為準)
第一天上午第一節(jié):基因數(shù)據(jù)庫使用介紹
測序標準報告的解讀。
NCBI Gene數(shù)據(jù)庫:最權(quán)威的基因綜合數(shù)據(jù)庫之一。
NCBI GEO數(shù)據(jù)庫:數(shù)據(jù)量最大的高通量公共數(shù)據(jù)庫。
GEO2R工具:在線做差異分析的R工具
bioDBnet:在線基因ID轉(zhuǎn)換工具。
Uniprot:最權(quán)威的蛋白綜合數(shù)據(jù)庫之一。
第一天上午第二節(jié):?DAVID工具——功能富集分析
?????????功能富集的原理和意義
基因ID轉(zhuǎn)換
?????????基因功能注釋(GO?,KEGG pathway)
?????????基因功能富集(GO?,KEGG pathway)
?????????基因功能聚類(GO?,KEGG pathway)
????????
第一天下午第三節(jié)?聚類熱圖及pathwaymap圖
KEGG?數(shù)據(jù)庫:最權(quán)威的通路數(shù)據(jù)庫(pathway map?分析)
HEMI軟件:構(gòu)建聚類熱圖的本地軟件
第一天下午第四節(jié). STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI)
?????????蛋白互作分析的原理和意義;
?????????單個蛋白的蛋白互作分析;
?????????多個蛋白的蛋白互作分析;
???????? STRING工具的使用步驟:輸入、參數(shù)設(shè)置、輸出等。
第二天上午第五節(jié)?cytoscape網(wǎng)絡(luò)做圖軟件(上)
?????????網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建
?????????逐個修改節(jié)點的屬性和修改邊的屬性
?????????網(wǎng)絡(luò)展示方式layout更美觀
?????????網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)計分析
????????
第二天下午第六節(jié)? cytoscape網(wǎng)絡(luò)做圖軟件(下)
?????????批量修改節(jié)點的屬性和修改邊的屬性
???????? Cytoscape的常用插件:ClusterONE
???????? Cytoscape的常用插件:BinGO
第二天下午第七節(jié)??答疑環(huán)節(jié)
通過該主題的學習,可以學會:
高通量公共數(shù)據(jù)的詳細信息查找/下載;
在線做差異表達分析
在線blast分析
基因ID轉(zhuǎn)換
通路map圖制作
功能富集分析
蛋白互作分析
網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建和美化。
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會議嘉賓
(最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準)
講師簡介:
宋博士
成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉(zhuǎn)錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項目分析思路設(shè)計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。
培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、沈陽、濟南、武漢等城市舉辦過十幾場培訓(xùn)班。培訓(xùn)的對象有:醫(yī)生、學生、科研工作者、生信愛好者等。
培訓(xùn)方向:《測序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學的魅力》、《生信文章實例解讀》、《生信與實驗的密切關(guān)系》、《生信與臨床醫(yī)學的關(guān)系》、《生信實用工具培訓(xùn)》、《多組學整合分析流程》、《R語言培訓(xùn)》等
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參會指南
會議門票
?注冊費:2500元每位(注冊費包含電子版教材、午餐,住宿費自理。)
優(yōu)惠政策:
1.?提前確認報名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學習材料
2.?三人組團報名,每人可優(yōu)惠100元
3.?四人組團報名,每人收費2300元,
4. ?五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!
可以開正規(guī)會務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。
特別說明:如果需要學習班的上外網(wǎng)路由神器,用于上google學術(shù)等國外網(wǎng)站,請自己在邀請函上加900元,我們會在你們的會務(wù)費發(fā)票上加900元,給您開發(fā)票,如果不需要神器,就是按照我們邀請函上的價格,神器可以至少保證用2年以后。
廣州班 ?08.18-08.19???????
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溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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