2018測(cè)序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班
時(shí)間:2018-05-26 08:00 至 2018-05-27 18:00
地點(diǎn):上海

- 參會(huì)報(bào)名
- 會(huì)議通知
- 會(huì)議日程
- 會(huì)議嘉賓
- 參會(huì)指南
-
手機(jī)下單
首頁 > 商務(wù)會(huì)議 > 醫(yī)療醫(yī)學(xué)會(huì)議 > 2018測(cè)序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班 更新時(shí)間:2018-05-15T16:33:13
(點(diǎn)擊可切換)
![]() |
![]() 2018測(cè)序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班 已截止報(bào)名會(huì)議時(shí)間: 2018-05-26 08:00至 2018-05-27 18:00結(jié)束 會(huì)議地點(diǎn): 上海 詳細(xì)地址會(huì)前通知 周邊酒店預(yù)訂 會(huì)議規(guī)模:50人 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技
|
會(huì)議通知
會(huì)議內(nèi)容 主辦方介紹

2018測(cè)序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班宣傳圖
【醫(yī)藥加】測(cè)序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學(xué)習(xí)班
生物信息學(xué)(bioinformatics)定義:是在大分子方面的概念型的生物學(xué),并且使用了信息學(xué)的技術(shù),這包括了從應(yīng)用數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)以及統(tǒng)計(jì)學(xué)等學(xué)科衍生而來各種方法,并以此在大尺度上來理解和組織與生物大分子相關(guān)的信息。
生物信息學(xué)魅力:
幫助預(yù)測(cè)疾病相關(guān)的潛在基因,以及該基因潛在的作用靶點(diǎn)、上游調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子等,從而指導(dǎo)實(shí)驗(yàn)方向、縮小試驗(yàn)范圍、簡(jiǎn)化試驗(yàn)流程。
為基金申請(qǐng)?zhí)峁┲С?,通過強(qiáng)大的信息數(shù)據(jù)的收集整理,減少投入增強(qiáng)研究目的性;且通過整合技術(shù)優(yōu)勢(shì),指導(dǎo)提高臨床診斷水平。
豐富的免費(fèi)的數(shù)據(jù)資源和生物軟件工具:數(shù)據(jù)庫:NCBI, EBI, DDBJ, PDB,SWISS-PROT等;軟件工具:Cytoscape,BLAST,? R語言,String,? David等。
本次培訓(xùn)目的:
很多老師都做過測(cè)序或者芯片實(shí)驗(yàn),雖然測(cè)序公司已經(jīng)給出了一部分的數(shù)據(jù)分析,比如過濾、質(zhì)控、比對(duì)、定量和差異等,但是這些分析屬于基礎(chǔ)傻瓜式的標(biāo)準(zhǔn)分析,并不能完整的講一個(gè)故事!因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力,從海量信息中獲得自己想要的關(guān)鍵基因!
培訓(xùn)預(yù)期:
通過2天的培訓(xùn),使學(xué)員掌握生信文獻(xiàn)分析思路和8個(gè)實(shí)用操作知識(shí)點(diǎn)(具體見最后),可以獨(dú)立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
我們可以看到該文獻(xiàn)主要的分析步驟有:差異表達(dá)分析、聚類熱圖構(gòu)建、GO和KEGG?通路分析、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析、生存曲線分析等。我們的主題基本上按照類似的文獻(xiàn)思路進(jìn)行講解,和大家一起分享一下一篇SCI文章的生信分析步驟。
通過2天的學(xué)習(xí),我們可以掌握一篇生信SCI文獻(xiàn)的所有分析模塊,并可以獨(dú)立的結(jié)合自己的研究方向進(jìn)行生信分析和數(shù)據(jù)挖掘,獲得一套屬于自己的分析結(jié)果。
通過該主題的學(xué)習(xí),可以學(xué)會(huì):
高通量公共數(shù)據(jù)的詳細(xì)信息查找/下載;
在線做差異表達(dá)分析
在線blast分析
基因ID轉(zhuǎn)換
通路map圖制作
功能富集分析
蛋白互作分析
網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建和美化。
查看更多
南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務(wù)于生命科學(xué)研究的專業(yè)技術(shù)型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營(yíng)管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術(shù)產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國(guó)乃至世界一流的生物技術(shù)產(chǎn)品供應(yīng)商。巴傲得生物長(zhǎng)期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價(jià)格、專業(yè)服務(wù),是我們?yōu)槟?wù)的宗旨。在細(xì)胞信號(hào)通路、免疫學(xué)、蛋白組學(xué)上擁有顯著優(yōu)勢(shì),其抗體產(chǎn)品、生長(zhǎng)因子等為生命科學(xué)科研工作者提供了極大的便利。
會(huì)議日程
(最終日程以會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)為準(zhǔn))
第一天上午第一節(jié):基因數(shù)據(jù)庫使用介紹
測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)報(bào)告的解讀。
NCBI Gene數(shù)據(jù)庫:最權(quán)威的基因綜合數(shù)據(jù)庫之一。
NCBI GEO數(shù)據(jù)庫:數(shù)據(jù)量最大的高通量公共數(shù)據(jù)庫。
GEO2R工具:在線做差異分析的R工具
bioDBnet:在線基因ID轉(zhuǎn)換工具。
Uniprot:最權(quán)威的蛋白綜合數(shù)據(jù)庫之一。
第一天上午第二節(jié):?DAVID工具——功能富集分析
?????????功能富集的原理和意義
基因ID轉(zhuǎn)換
?????????基因功能注釋(GO?,KEGG pathway)
?????????基因功能富集(GO?,KEGG pathway)
?????????基因功能聚類(GO?,KEGG pathway)
????????
第一天下午第三節(jié)?聚類熱圖及pathwaymap圖
KEGG?數(shù)據(jù)庫:最權(quán)威的通路數(shù)據(jù)庫(pathway map?分析)
HEMI軟件:構(gòu)建聚類熱圖的本地軟件
第一天下午第四節(jié). STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI)
?????????蛋白互作分析的原理和意義;
?????????單個(gè)蛋白的蛋白互作分析;
?????????多個(gè)蛋白的蛋白互作分析;
???????? STRING工具的使用步驟:輸入、參數(shù)設(shè)置、輸出等。
第二天上午第五節(jié)?cytoscape網(wǎng)絡(luò)做圖軟件(上)
?????????網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建
?????????逐個(gè)修改節(jié)點(diǎn)的屬性和修改邊的屬性
?????????網(wǎng)絡(luò)展示方式layout更美觀
?????????網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)計(jì)分析
????????
第二天下午第六節(jié)? cytoscape網(wǎng)絡(luò)做圖軟件(下)
?????????批量修改節(jié)點(diǎn)的屬性和修改邊的屬性
???????? Cytoscape的常用插件:ClusterONE
???????? Cytoscape的常用插件:BinGO
第二天下午第七節(jié)??答疑環(huán)節(jié)
查看更多
會(huì)議嘉賓
(最終出席嘉賓以會(huì)議現(xiàn)場(chǎng)為準(zhǔn))
講師宋博士簡(jiǎn)介:
成果:參與完成了近百篇軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請(qǐng);肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構(gòu)建;完成個(gè)體基因檢測(cè)流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗(yàn),擅長(zhǎng)方向有轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機(jī)理研究分析、疾病預(yù)后與基因關(guān)聯(lián)分析、項(xiàng)目分析思路設(shè)計(jì)以及個(gè)性化分析等,精通perl、R等編程語言。
培訓(xùn)經(jīng)歷:在上海、沈陽、濟(jì)南、武漢等城市舉辦過十幾場(chǎng)培訓(xùn)班。培訓(xùn)的對(duì)象有:醫(yī)生、學(xué)生、科研工作者、生信愛好者等。
培訓(xùn)方向:
《測(cè)序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學(xué)的魅力》、《生信文章實(shí)例解讀》、《生信與實(shí)驗(yàn)的密切關(guān)系》、《生信與臨床醫(yī)學(xué)的關(guān)系》、《生信實(shí)用工具培訓(xùn)》、《多組學(xué)整合分析流程》、《R語言培訓(xùn)》等
查看更多
參會(huì)指南
會(huì)議門票
注冊(cè)費(fèi):2500元每位(注冊(cè)費(fèi)包含電子版教材、午餐,住宿費(fèi)自理。)
優(yōu)惠政策:
1.?提前確認(rèn)報(bào)名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學(xué)習(xí)材料
2.?三人組團(tuán)報(bào)名,每人可優(yōu)惠100元
3.?四人組團(tuán)報(bào)名,每人收費(fèi)2300元,
4. ?五人組團(tuán)報(bào)名繳費(fèi),額外帶一人免費(fèi)注冊(cè)!
可以開正規(guī)會(huì)務(wù)發(fā)票,紙質(zhì)邀請(qǐng)函(蓋紅章)。?
查看更多
溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動(dòng)延期或取消,建議“異地客戶”與活動(dòng)家客服確認(rèn)參會(huì)信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動(dòng)各項(xiàng)資源需提前采購(gòu),購(gòu)票后不支持退款,可以換人參加。
您可能還會(huì)關(guān)注
-
2025(第八屆)多組學(xué)研究與臨床轉(zhuǎn)化前沿論壇
2025-06-27 上海
-
2025中國(guó)研究型醫(yī)院大會(huì)
2025-07-18 濟(jì)南
-
第26屆眼底病學(xué)術(shù)交流會(huì)議暨國(guó)際視網(wǎng)膜研討會(huì)(Retina China 2025)
2025-06-04 北京
-
2025年DIA藥物信息大會(huì)暨展覽會(huì)
2025-05-19 上海