第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班2019(1月上海班)
時間:2019-01-12 08:00 至 2019-01-13 18:00
地點:上海

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首頁 > 商務會議 > 醫(yī)療醫(yī)學會議 > 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班2019(1月上海班) 更新時間:2018-12-18T14:26:28
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![]() 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班2019(1月上海班) 已截止報名會議時間: 2019-01-12 08:00至 2019-01-13 18:00結束 會議地點: 上海 上海好望角大飯店 上海市徐匯區(qū)肇嘉浜路500號 周邊酒店預訂 主辦單位: 上海遐永醫(yī)藥科技 醫(yī)藥加科研培訓中心
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會議介紹
會議內(nèi)容 主辦方介紹

第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班2019(1月上海班)宣傳圖
第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班
上海班:2019/1/12-13 (11號報到)
上海好望角飯店
注意事項:攜帶windows系統(tǒng)的電腦,蘋果電腦請務必提前做好雙系統(tǒng)?,F(xiàn)場不得錄音錄像。
通過該主題的學習,可以學會:
高通量公共數(shù)據(jù)的詳細信息查找/下載;
在線做差異表達分析
在線blast分析
基因ID轉換
通路map圖制作
功能富集分析
蛋白互作分析
網(wǎng)絡圖的構建和美化。
學習班簡介
高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析是基于生信的方法從芯片及測序高通量數(shù)據(jù)中挖掘到與研究方向最相關的靶標基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。隨著高通量手段的不斷進步,測序和芯片的成本也逐漸降低,速度也越來越快,使用高通量手段(測序/芯片)進行科研的優(yōu)點非常明顯,也是大勢所趨!?
做過測序或者芯片實驗的科研人員越來越多,雖然測序公司已經(jīng)給出了一部分的數(shù)據(jù)分析,比如過濾、質(zhì)控比對、定量和差異等,但是這些分析屬于基礎傻瓜式的標準分析,并不能完整的講一個故事!我們也很難在大量的差異基因中篩選獲得關鍵基因。因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力,從海量信息中獲得自己想要的關鍵基因!
培訓目的與培訓預期
培訓目的:很多學員都做過測序或者芯片實驗,雖然測序公司已經(jīng)給出了一部分的數(shù)據(jù)分析,比如過濾、質(zhì)控、比對、定量和差異等,但是這些分析屬于基礎傻瓜式的標準分析,并不能完整的講一個故事!因此,需要我們自己掌握高通量數(shù)據(jù)挖掘的能力,從海量信息中獲得自己想要的關鍵基因!
培訓預期:通過2天的培訓(半天理論課程+1天半實踐操作),使學員掌握生信文獻分析思路和8個實用操作知識點(具體見最后),可以獨立完成一篇基于公共數(shù)據(jù)庫的高通量數(shù)據(jù)挖掘分析。
培訓時間與培訓地點
培訓時間:2019/1/12-13 (11號報到)
培訓地點:上海好望角飯店 ?上海市徐匯區(qū)肇嘉浜路500號5樓會議室
學習班組織方
主辦方:醫(yī)藥加科研培訓中心
承辦方:上海遐錦生物科技有限公司
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是專一服務于生命科學研究的專業(yè)技術型企業(yè)。是一大批志同道合的資深專業(yè)人士共同創(chuàng)辦的具有現(xiàn)代化經(jīng)營管理水平的生物高科技企業(yè),從事生物技術產(chǎn)品的開發(fā)及銷售,致力于將巴傲得生物打造成中國乃至世界一流的生物技術產(chǎn)品供應商。巴傲得生物長期備有Bioworld抗體現(xiàn)貨4000多種抗體可以在一周左右送到客戶的手里。精湛品質(zhì)、合理價格、專業(yè)服務,是我們?yōu)槟盏淖谥?。在細胞信號通路、免疫學、蛋白組學上擁有顯著優(yōu)勢,其抗體產(chǎn)品、生長因子等為生命科學科研工作者提供了極大的便利。

舉辦了2018腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(12月北京班) 2019臨床預測模型構建與基于R語言統(tǒng)計分析學習班(01.05-01.06北京班) 2019全國循證醫(yī)學Meta分析及網(wǎng)狀Meta三天精講學習班(1月北京班) 第10期測序與芯片高通量數(shù)據(jù)挖掘與分析學習班2019(1月上海班) 2019腸道菌群與代謝組學國自然課題設計及研究策略專題會議(1月上海班) 2019國自然基金標書構思與撰寫學習班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量數(shù)據(jù)挖掘?qū)n}學習班2019(1月上海班) 第8期醫(yī)學SCI論文寫作及發(fā)表技巧學習班2019(1月上海班) ......
會議日程
(最終日程以會議現(xiàn)場為準)
課程具體安排
1、理論課程:第一天上午
8.30-10:00第一節(jié):基因數(shù)據(jù)庫使用介紹
測序標準報告的解讀。
NCBI Gene數(shù)據(jù)庫:最權威的基因綜合數(shù)據(jù)庫之一。
NCBI GEO數(shù)據(jù)庫: 數(shù)據(jù)量最大的高通量公共數(shù)據(jù)庫。
GEO2R工具:在線做差異分析的R工具
bioDBnet:在線基因ID轉換工具。
Uniprot: 最權威的蛋白綜合數(shù)據(jù)庫之一。
10.15-12:00第二節(jié): DAVID工具——功能富集分析
功能富集的原理和意義
基因ID轉換
基因功能注釋(GO ,KEGG pathway)
基因功能富集(GO ,KEGG pathway)
基因功能聚類(GO ,KEGG pathway)
2、實踐操作課程(共1天半)
第一天下午
13:30-17:30第三節(jié) 聚類熱圖及pathway map圖
KEGG 數(shù)據(jù)庫:最權威的通路數(shù)據(jù)庫(pathway map 分析)
HEMI軟件:構建聚類熱圖的本地軟件
第二天上午
8:30-10:00第四節(jié). STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI)
蛋白互作分析的原理和意義;
單個蛋白的蛋白互作分析;
多個蛋白的蛋白互作分析;
STRING工具的使用步驟:輸入、參數(shù)設置、輸出等。
10:15-12:00第五節(jié) cytoscape網(wǎng)絡做圖軟件(上)
網(wǎng)絡圖構建
逐個修改節(jié)點的屬性和修改邊的屬性
網(wǎng)絡展示方式layout更美觀
網(wǎng)絡統(tǒng)計分析
13:30-15:30第六節(jié) ?cytoscape網(wǎng)絡做圖軟件(下)
批量修改節(jié)點的屬性和修改邊的屬性
Cytoscape的常用插件:ClusterONE
Cytoscape的常用插件:BinGO
15:30-17:00 ?答疑環(huán)節(jié)
通過該主題的學習,可以學會:
高通量公共數(shù)據(jù)的詳細信息查找/下載;
在線做差異表達分析
在線blast分析
基因ID轉換
通路map圖制作
功能富集分析
蛋白互作分析
網(wǎng)絡圖的構建和美化。
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會議嘉賓
(最終出席嘉賓以會議現(xiàn)場為準)
講師簡介
宋偉博士
成果:參與完成了近百篇軟件著作權和發(fā)明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數(shù)據(jù)庫的分析和構建;完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向:有近十年的生信分析經(jīng)驗,擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數(shù)據(jù)分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯(lián)分析、項目分析思路設計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。
培訓經(jīng)歷:在上海、沈陽、濟南、武漢等城市舉辦過十幾場培訓班。培訓的對象有:醫(yī)生、學生、科研工作者、生信愛好者等。
培訓方向:《測序與芯片數(shù)據(jù)分析》、《生物信息學的魅力》、《生信文章實例解讀》、《生信與實驗的密切關系》、《生信與臨床醫(yī)學的關系》、《生信實用工具培訓》、《多組學整合分析流程》、《R語言培訓》等
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參會指南
會議門票 場館介紹
學習費2800元每位(學習費包含電子版教材、午餐,住宿費自理,保證學員完全掌握。)
優(yōu)惠政策:
1. 提前支付轉賬的可提前拿到學習資料
2. 三人組團報名,每人收費2700元
3. ?四人組團報名,每人收費2600元
4. ?五人組團報名繳費,額外帶一人免費注冊!?
5. 參加過醫(yī)藥加TCGA/GEO數(shù)據(jù)挖掘的學員只要再支付1000元
可以開正規(guī)會務發(fā)票,紙質(zhì)邀請函(蓋紅章)。?
注意事項:攜帶windows系統(tǒng)的電腦,蘋果電腦請務必提前做好雙系統(tǒng)?,F(xiàn)場不得錄音錄像。
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交通指南:
打浦橋地區(qū)
駕車距離2.3公里(約4份鐘)
浦東國際機場
駕車距離41.5公里(約58分鐘)
虹橋國際機場
駕車距離15.0公里(約22分鐘)
虹橋火車站
駕車距離16.6公里(約29分鐘)
上海火車站
駕車距離6.4公里(約13分鐘)
市中心
駕車距離5.公里(約11分鐘)
豫園
駕車距離5.5公里(約12分鐘)
南京路步行街
駕車距離5.5公里(約11分鐘)
上海好望角大飯店位于上海徐家匯附近的繁華地帶,是全國科技系統(tǒng)首家涉外接待單位。
上海好望角大飯店是集會議、住宿、餐飲、健身、商務、娛樂、購物等功能于一體的一座現(xiàn)代化的會議大廈。
飯店所配備的現(xiàn)代化硬件設施和相配套的軟件系統(tǒng),不僅是中國科學院對外進行學術交流和接待國內(nèi)外科學家、教授、學者的窗口,也是海內(nèi)外商務或旅游賓客來滬下榻的理想飯店之一。
飯店客房的設計和布置根據(jù)科學家和商務客人的生活需要而特意安排的,房間內(nèi)生活功能一應俱全,小巧而衛(wèi)生,精致而儒雅是好望角客房的特色之一。優(yōu)質(zhì)的居住氛圍和專業(yè)的商務配備,是賓客放松身心、辦公洽談的理想之地。
溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規(guī)則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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